Wissenschaftliche*r Mitarbeiter*in am Institut für Biological Data Science (m/w/d)

Die Heinrich-Heine-Universität sucht am Institut für Biological Data Science zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine*n

Wissenschaftliche*r Mitarbeiter*in (m/w/d)

Aufgabenschwerpunkte

• Lehre an der HHU WE Biologie in der pflanzlichen Genomik und verwandten Disziplinen
• Unterstützung der WE Biologie bei der Nutzung von elabFTW
• Analyse von epigentischen Signalen in Pflanzen und Entwicklung geeigneter Software
• Analyse pflanzlicher Pangenome sowie ggfs. Metagenomen
• Betreuung studentischer Abschlussarbeiten
• Schreiben von Publikationen, Berichten sowie Anträgen
• Interkation mit CEPLAS, TRR341, MibiNet und anderen wichtigen Verbundprojekten der HHU

Ihr Profil

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Studium (Master, Diplom) mit Promotion im Bereich Informatik, Bioinformatik, Biowissenschaften oder einer vergleichbaren Disziplin
• Erfahrung mit Git und Git-basierten IT-Lösungen und Open-Source-Lösungen
• Gute Programmierkenntnisse in C++ und Phyton
• Hands on Erfahrungen mit Oxford Nanopore Daten bei Pflanzen sowie deren Sequenzierung
• Grössenanalyse mittels Pulse Field Gel Elektrophorese
• nachgewiesene Erfahrung bei der Analyse von CpG, CHG und CHH Methylierungsdaten bei Nanopore und Bisulfit sowie CpG bei PacBio
• Erfahrung in der Assemblierung und Analyse grosser pflanzlicher Genome (>10Gbasen)
• nachgewiesene Erfahrung beim Umgang mit deep neuronal network basierenden strukturellen Annotierungsmechanismen
• Analyse von Genfamilien mittels HMM basierender Analyse zwischen pflanzlichen Genomen sowie strukturelle und funktionelle Annotation von sehr grossen Datensätzen (>500 pflanzliche Genome)
• Analyse von Transposons in pflanzlichen Genomen
• Analyse von pflanzlichen Pangenomen
• Lehrerfahrung in der pflanzlichen Genomik und Bioinformatik
• Kenntnisse in der Metagenomik und relevanten CAMI Benchmarks
• Kenntnisse in der phylogenetischen Analyse
• Erfahrung und sicherer Umgang mit elabFTW
• Erfahrung und sicherer Umgang mit NFDI DataPLANT ARC
• Gute interdisziplinäre Kommunikationsfähigkeiten sowie Deutsch und Englisch in Wort und Schrift
• Teamfähigkeit, sowie Service- und lösungsorientierte Arbeitsweise
• Linux Administration
• Wünschenswert sind Erfahrungen mit Labor Organisation

Über uns

Die Heinrich-Heine-Universität vertritt das Prinzip „Exzellenz durch Vielfalt“. Sie hat die „Charta der Vielfalt“ unterzeichnet und erfolgreich am Audit „Vielfalt gestalten“ des Stifterverbandes teilgenommen. Sie ist als familiengerechte Hochschule zertifiziert und hat sich zum Ziel gesetzt, die Vielfalt unter ihren Mitarbeiter*innen zu fördern.Bewerbungen von Menschen aller Geschlechter sind ausdrücklich erwünscht. Bewerbungen von Frauen werden nach Maßgabe des Landesgleichstellungsgesetzes bevorzugt berücksichtigt. Die Bewerbung schwerbehinderter und ihnen gleichgestellter behinderter Menschen ist ebenso erwünscht. Zur Berücksichtigung einer Schwerbehinderung oder Gleichstellung weisen Sie diese bitte durch geeignete Unterlagen nach.

Entgeltgruppe:
EGr. 13 TV-L

Organisationseinheit:
Mathematisch-Naturwissen­schaftliche Fakultät

Bitte bewerben Sie sich über das angegeben Portal und sehen Sie von Bewerbungen per E-Mail ab.

Kontakt
Björn Usadel, Institutsleitung
021181-12096